アスペルガー症候群のコアとなる症状を根治することはできません。しかし、早期に専門的な介入を受け、行動マネジメントやソーシャルスキルのトレーニングを受けることによって、多くのこどもが改善を見せます。医師は治療にはどの方法が効果的であるかを進めてくれるはずです。治療方法には以下のようなものがあります。
明確で決められた方法で、アスペルガー症候群の子どもはコミュニケーションとソーシャルスキルの方法を学ぶことができます。また。自然なリズムの会話や、ジェスチャー、アイコンタクト、声のトーン、ユーモア、皮肉などのコミュニケーション技術も学ぶことは可能です。
認知行動療法は執着、怒りの爆発などの問題行動を抑えることを目的としています。また、感情の理解や不安への対処法などのスキルを向上させることも目的としています。認知行動療法は子どもに困難な場面（例えば初めての場所やイベントなど）を理解させ、その場面に対してどのように対処すれば四以下を選択させる訓練に焦点を当てます。
アスペルガー症候群自体に友好的な薬剤はありません。しかし、不安、うつ、活動過剰など、アスペルガー症候群の子どもの多くが示す症状に関しては、投薬によって改善することができます。